[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 23، شماره 4 - ( مهر و آبان 1397 ) ::
جلد 23 شماره 4 صفحات 516-527 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی جایگاه‌های چند شکلی مهم بر روی ژن MSH2 در نمونه‌های سرطان کلورکتال با استفاده از آنالیز نقطه ذوب با وضوح بالا
محسن نعمتی1 ، سید عبدالحمید انگجی 2، سعید آیریان1 ، عباس بهاری3
1- گروه زیست سلولی و مولکولی ، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران
2- گروه زیست سلولی و مولکولی ، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران ، ershad110@yahoo.com
3- گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده فناوری‌های نوین زیستی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران
چکیده:   (182 مشاهده)
چکیده
زمینه و هدف: سرطان کلورکتال(CRC) دومین سرطان شایع در کشورهای توسعه یافته است. بیشتر از 10 درصد CRC به صورت ارثی می‌باشد و شامل سندرم لینچ HNPCC وFAP  می‌باشد. ژن MSH2 بر روی کروموزم 2(p21) قرار دارد و از 16 اگزون تشکیل شده است. MSH2 پروتئینی است که در فرایند ترمیمی‌MMR بعد از همانندسازیDNA نقش دارد. پروتئین MSH2 به MSH6 یا MSH3 متصل شده و کمپلکس‌های MutSα و MutSβ را تشکیل میدهد که به ترتیب ناجورجفت‌های deletion/insertion کوچک و بزرگ را شناسایی می‌کنند. هدف اصلی این تحقیق بررسی کارایی و توانایی HRMA در تشخیص جهش­های حذفی سه نوکلئوتیدی و تعیین فراوانی این جهش‌ها در حالت هموزیگوس وهتروزیگوس در نمونه‌های سرطان روده بزرگ نسبت به گروه کنترل می‌باشد.
روش بررسی: در پژوهش موردـ شاهدی که در سال 1396ـ 1395 انجام شد، به منظور ردیابی جهش حذفی سه نوکلئوتیدیGTG در موقعیت اگزون 12 ژن MSH2 از تکنیک HRMA استفاده شد. بدین منظور50 نمونه سرطان کلورکتال به همراه 50 نمونه سالم مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا DNA ژنومی ‌از نمونه‌های بافت پارافینه سرطانی استخراج شد و سپس با تکنیک HRMA و تعیین توالی یابی مستقیم جهش حذفی سه نوکلئوتیدی GTG مورد بررسی قرار گرفت. کنترل‌های به کار گرفته شده شامل توالی 96 جفت بازی در حالت تیپ وحشی و 93 جفت‌بازی در حالت موتانت بود. نسبت مساوی از این دو برای حالت هتروزیگوس این جایگاه به کار گرفته شد. در نهایت تعداد نمونه‌های به دست آمده در هر گروه در آزمون تجزیه واریانس یک‌طرفه و مقایسه میانگین LSD مورد مقایسه آماری قرار گرفتند.
یافته‌ها: تعداد نمونه­های هتروزیگوس برای این جایگاه در نمونه­های سرطان روده بزرگ به طور معنی‌داری نسبت به دو گروه هموزیگوس حاوی توالی و هموزیگوس حذف کامل بیشتر بود. در مجموع نتایج این پژوهش نشان داد که تکنیک HRMA قابلیت تفکیک حذف و الحاق جفت بازها به صورت هموزیگوس و هتروزیگوت را با توجه به اختلاف دمای ذوب(Tm) آنها را دارد
نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر با توجه به نتایج به دست آمده فراوانی حذف سه نوکلئوتیدی GTG در نمونه‌های سرطانی نسبت به افراد سالم به صورت معنی‌داری بیشتر بود.
 
سرطان کلورکتال، HNPCC، تکنیکHRMA، ژن MSH2
واژه‌های کلیدی: سرطان کلورکتال
متن کامل [PDF 2640 kb]   (61 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بیوشیمی
دریافت: ۱۳۹۶/۶/۵ | پذیرش: ۱۳۹۷/۵/۲۶ | انتشار: ۱۳۹۷/۷/۱۰
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Nemati M, Angji A, Aryan S, Bahari A. Identification of Important Polymorphic Sites on MSH2 Gene in Colorectal Cancer Samples Using High Resolution Melting Point Analysis . Armaghane danesh. 2018; 23 (4) :516-527
URL: http://armaghanj.yums.ac.ir/article-1-1919-fa.html

نعمتی محسن، انگجی سید عبدالحمید، آیریان سعید، بهاری عباس. شناسایی جایگاه‌های چند شکلی مهم بر روی ژن MSH2 در نمونه‌های سرطان کلورکتال با استفاده از آنالیز نقطه ذوب با وضوح بالا. ارمغان دانش. 1397; 23 (4) :516-527

URL: http://armaghanj.yums.ac.ir/article-1-1919-fa.html



دوره 23، شماره 4 - ( مهر و آبان 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
ارمغان دانش Armaghane danesh
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 32 queries by YEKTAWEB 3844