TY - JOUR T1 - Bioinformatics Identification of miRNA-mRNA Regulatory Network Contributing to Lung Cancer Invasion TT - شناسایی بیوانفورماتیکی شبکه تنظیمی mRNA-miRNA دخیل در تهاجم سرطان ریه JF - yums-armaghan JO - yums-armaghan VL - 27 IS - 4 UR - http://armaghanj.yums.ac.ir/article-1-3249-fa.html Y1 - 2022 SP - 430 EP - 441 KW - Bioinformatics KW - miRNA-mRNA regulatory network KW - Lung cancer N2 - زمینه و هدف: در طول 15 سال گذشته، بینش قابل توجهی در مورد نقش miRNAها در سرطان حاصل شده است. در سرطان­های مختلف، miRNAها می­توانند به عنوان آنکوژن یا سرکوب کننده تومور عمل کنند و یا با تنظیم بیان ژن‌های هدف متعدد، فرآیند متاستاز را کنترل نمایند. لذا هدف از این مطالعه شناسایی بیوانفورماتیکی شبکه تنظیمی mRNA-miRNA دخیل در تهاجم سرطان ریه بود. روش بررسی: در این مطالعه تجربی که در سال1400 انجام شد پروفایل بیانی ژن­های بیماران مبتلا به سرطان ریه، از داده­های RNAseq موجود در پایگاه داده اطلس ژنوم سرطان (TCGA) با استفاده از پکیج TCGAbiolinks تهیه شد. mRNAها و miRNAها با بیان متفاوت با استفاده از پکیج­های edgeR و limma در نرم­افزار R شناسایی شدند و در ادامه با کمک دو پایگاه TargetScan و miRWalk، اهداف آنها پیش بینی شد. متعاقباً، شبکه تنظیم‌کننده تعامل miRNA-mRNA با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape به تصویر کشیده شد. داده‌‌های جمع‌آوری شده با استفاده از آزمون‌های فرض چندگانه(Multiple hypothesis testing)و میزان کشف اشتباه (False Discovery Rate) تجزیه و تحلیل شدند. یافته‌ها: نتایج بیوانفورماتیکی شناسایی شبکه تنظیمی miRNA-mRNA اختصاصی تهاجم سرطان ریه، نشان داد که شش miRNA هاب، شامل؛ hsa-let-7c-5p، hsa-let-7b-5p، hsa-let-7e-5p، hsa-miR-6838-5p، hsa-miR-320b و hsa-miR-4458تنظیم کننده ژن­های افزایش یافته در وضعیت تهاجم ریه و چهار miRNA هاب، تنظیم کننده ژن­های کاهش یافته در این وضعیت، شامل؛ hsa-miR-92a-3p، hsa-miR-204-5p، hsa-miR-24-3p و hsa-miR-506-3P می­باشند. نتیجه­گیری: یافته‌های مطالعه حاضر نشان می‌دهد که یک شبکه miRNA-mRNA خاص با تهاجم سرطان ریه مرتبط است که این بینش جدید در مورد مکانیسم مولکولی تهاجم سرطان ریه به شناسایی بیومارکرهای مولکولی و اهداف درمانی برای این بدخیمی می­انجامد. miRNA-mRNA، M3 10.52547/armaghanj.27.4.430 ER -