[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 27، شماره 4 - ( 4-1401 ) ::
جلد 27 شماره 4 صفحات 441-430 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی بیوانفورماتیکی شبکه تنظیمی mRNA-miRNA دخیل در تهاجم سرطان ریه
خلیل خاشعی ورنامخواستی1 ، مهدی مغنی باشی 2، سیروس نعیمی1
1- گروه ژنتیک، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران
2- گروه ژنتیک، واحد کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی، کازرون، ایران ، mehdimoghani@yahoo.com
چکیده:   (456 مشاهده)
زمینه و هدف: در طول 15 سال گذشته، بینش قابل توجهی در مورد نقش miRNAها در سرطان حاصل شده است. در سرطان­های مختلف، miRNAها می­توانند به عنوان آنکوژن یا سرکوب کننده تومور عمل کنند و یا با تنظیم بیان ژن‌های هدف متعدد، فرآیند متاستاز را کنترل نمایند. لذا هدف از این مطالعه شناسایی بیوانفورماتیکی شبکه تنظیمی mRNA-miRNA دخیل در تهاجم سرطان ریه بود.
 
روش بررسی: در این مطالعه تجربی که در سال1400 انجام شد پروفایل بیانی ژن­های بیماران مبتلا به سرطان ریه، از داده­های RNAseq موجود در پایگاه داده اطلس ژنوم سرطان (TCGA) با استفاده از پکیج TCGAbiolinks تهیه شد. mRNAها و miRNAها با بیان متفاوت با استفاده از پکیج­های edgeR و limma در نرم­افزار R شناسایی شدند و در ادامه با کمک دو پایگاه TargetScan و miRWalk، اهداف آنها پیش بینی شد. متعاقباً، شبکه تنظیم‌کننده تعامل miRNA-mRNA با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape به تصویر کشیده شد. داده‌‌های جمع‌آوری شده با استفاده از آزمون‌های فرض چندگانه(Multiple hypothesis testing)و میزان کشف اشتباه (False Discovery Rate) تجزیه و تحلیل شدند.
 
یافته‌ها: نتایج بیوانفورماتیکی شناسایی شبکه تنظیمی miRNA-mRNA اختصاصی تهاجم سرطان ریه، نشان داد که شش miRNA هاب، شامل؛ hsa-let-7c-5p، hsa-let-7b-5p، hsa-let-7e-5p، hsa-miR-6838-5p، hsa-miR-320b و  hsa-miR-4458تنظیم کننده ژن­های افزایش یافته در وضعیت تهاجم ریه و چهار miRNA هاب، تنظیم کننده ژن­های کاهش یافته در این وضعیت، شامل؛ hsa-miR-92a-3p، hsa-miR-204-5p، hsa-miR-24-3p و hsa-miR-506-3P می­باشند.
 
نتیجه­گیری: یافته‌های مطالعه حاضر نشان می‌دهد که یک شبکه miRNA-mRNA خاص با تهاجم سرطان ریه مرتبط است که این بینش جدید در مورد مکانیسم مولکولی تهاجم سرطان ریه به شناسایی بیومارکرهای مولکولی و اهداف درمانی برای این بدخیمی می­انجامد.
  
miRNA-mRNA،
واژه‌های کلیدی: سرطان ریه، بیوانفورماتیک، شبکه تنظیمی
متن کامل [PDF 1559 kb]   (179 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: تخصصي
دریافت: 1400/11/2 | پذیرش: 1401/3/17 | انتشار: 1401/4/18
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Khashei Varnamkhasti K, Moghanibashi M, Naeimi S. Bioinformatics Identification of miRNA-mRNA Regulatory Network Contributing to Lung Cancer Invasion. armaghanj 2022; 27 (4) :430-441
URL: http://armaghanj.yums.ac.ir/article-1-3249-fa.html

خاشعی ورنامخواستی خلیل، مغنی باشی مهدی، نعیمی سیروس. شناسایی بیوانفورماتیکی شبکه تنظیمی mRNA-miRNA دخیل در تهاجم سرطان ریه. ارمغان دانش 1401; 27 (4) :441-430

URL: http://armaghanj.yums.ac.ir/article-1-3249-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 27، شماره 4 - ( 4-1401 ) برگشت به فهرست نسخه ها
ارمغان دانش Armaghane Danesh
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 29 queries by YEKTAWEB 4540